More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0207 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  75.12 
 
 		 436 aa  687    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 435 aa  882    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  75.35 
 
 		 436 aa  683    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  76.27 
 
 		 436 aa  695    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  76.73 
 
 		 436 aa  699    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  45.83 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  41.49 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  41 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  41.9 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  40.52 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  41.2 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  40.42 
 
 		 451 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  40.37 
 
 		 418 aa  329  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  40.42 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  42.07 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  39.49 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  41.5 
 
 		 418 aa  325  9e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  41.22 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  40.47 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  40.66 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  39.77 
 
 		 427 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  40.43 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  41.45 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  40.43 
 
 		 414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  41.13 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  40.43 
 
 		 414 aa  319  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  39.85 
 
 		 417 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  40.54 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  39.39 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  39.1 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 417 aa  316  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  38.86 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  38.86 
 
 		 417 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 416 aa  316  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  39.9 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  39.72 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  39.85 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  38.82 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  40.57 
 
 		 420 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  39.38 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  39.44 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  41.53 
 
 		 416 aa  312  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  38.86 
 
 		 427 aa  312  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  41.06 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  41.19 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  39.35 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  38.89 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  37.47 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  39.67 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  39.2 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  39.63 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  37.86 
 
 		 414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  40.57 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  40.57 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  38.06 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  38.33 
 
 		 415 aa  305  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  39.37 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  37.93 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  38.69 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  38.92 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  39.24 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  38.77 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  37.18 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  40.33 
 
 		 414 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  38.14 
 
 		 427 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  39.38 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  40.68 
 
 		 414 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  39.49 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  37.16 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  39.12 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  40.33 
 
 		 414 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  38.19 
 
 		 417 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  37.76 
 
 		 415 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  38.92 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  38.92 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  38.22 
 
 		 415 aa  302  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  36.93 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2916  diaminopimelate decarboxylase  38.26 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0948953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  41.45 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  38.68 
 
 		 415 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  40.09 
 
 		 414 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  37.83 
 
 		 414 aa  299  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  39.13 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  39.13 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  39.13 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  39.13 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  37.3 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>