More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0131 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  57.32 
 
 		 749 aa  920    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  100 
 
 		 808 aa  1624    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  58.69 
 
 		 776 aa  921    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  57.8 
 
 		 749 aa  923    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  56.95 
 
 		 751 aa  911    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  38.36 
 
 		 769 aa  533  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  35.42 
 
 		 749 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  31.07 
 
 		 851 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  31.21 
 
 		 820 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  31.4 
 
 		 829 aa  442  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  31.89 
 
 		 833 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  33.81 
 
 		 745 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  33.29 
 
 		 763 aa  405  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  31.73 
 
 		 754 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  33.66 
 
 		 750 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  35.22 
 
 		 938 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.33 
 
 		 756 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  36.48 
 
 		 751 aa  320  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  33.9 
 
 		 836 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 		 502 aa  273  7e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  27.01 
 
 		 971 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  27.1 
 
 		 941 aa  197  8.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 		 1528 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  28.34 
 
 		 1565 aa  182  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  26.18 
 
 		 551 aa  171  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  39.68 
 
 		 233 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  37.14 
 
 		 228 aa  112  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  32.38 
 
 		 216 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  32.72 
 
 		 234 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  35.05 
 
 		 230 aa  107  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  35.89 
 
 		 212 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  36.11 
 
 		 212 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  35.87 
 
 		 217 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  36.46 
 
 		 212 aa  91.3  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  31.43 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  32.13 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  24.8 
 
 		 555 aa  73.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  24.46 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  23.41 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  28.17 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  31.46 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  35.71 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  33.56 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  24.08 
 
 		 572 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  26.39 
 
 		 220 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 1122 aa  62  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0970  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.64 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  23.73 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  24.12 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  23.73 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  23.73 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  23.73 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  26.82 
 
 		 214 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  23.73 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  24.12 
 
 		 560 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  23.73 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.93 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  33.04 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1144 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.95 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  34.75 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  28.46 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  30.77 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.87 
 
 		 1169 aa  58.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  22.06 
 
 		 1172 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1018  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.83 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.97 
 
 		 462 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0341  DEAD/DEAH box helicase-like  31.9 
 
 		 529 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0103074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.72 
 
 		 432 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.93 
 
 		 1134 aa  57  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.5 
 
 		 854 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  21 
 
 		 1170 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1354  type III restriction enzyme, res subunit  23.68 
 
 		 660 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0575606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  23.92 
 
 		 1013 aa  57  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2794  ATP-dependent RNA helicase SrmB  34.51 
 
 		 446 aa  56.2  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.17 
 
 		 1169 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.68 
 
 		 479 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3679  ATP-dependent RNA helicase SrmB  30.51 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0397087  normal  0.205211 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  27.78 
 
 		 465 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  30.92 
 
 		 1269 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1114  predicted protein  26.98 
 
 		 478 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0466739  normal  0.893767 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.2 
 
 		 551 aa  55.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0291  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 577 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.279788 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01750  ATP-dependent RNA helicase mak5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCI0]  26.5 
 
 		 770 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  31.67 
 
 		 426 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 492 aa  55.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  34.78 
 
 		 428 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10010  DEAD/DEAH box ATP-dependent RNA helicase  32.17 
 
 		 434 aa  55.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00123792  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl525  ATP-dependent RNA helicase  31.53 
 
 		 666 aa  55.1  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.23 
 
 		 536 aa  55.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1015  DEAD/DEAH box helicase-like  28.57 
 
 		 393 aa  55.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004056  ATP-dependent RNA helicase  33.62 
 
 		 402 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.668799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01406  hypothetical protein  30.83 
 
 		 411 aa  54.7  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  29.3 
 
 		 158 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 585 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>