More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0033 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
336 aa  682    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  76.79 
 
 
337 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  77.38 
 
 
338 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  77.38 
 
 
337 aa  557  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  76.19 
 
 
338 aa  555  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  56.55 
 
 
350 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 
346 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 
337 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 
337 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 
336 aa  378  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 
333 aa  373  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  49.1 
 
 
332 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  46.11 
 
 
337 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  46.13 
 
 
336 aa  309  5e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  46.69 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  46.99 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  43.67 
 
 
335 aa  290  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  44.28 
 
 
337 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  40.24 
 
 
338 aa  223  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  32.78 
 
 
432 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 
431 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  34.2 
 
 
429 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  33.49 
 
 
431 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 
431 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  33.97 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  33.18 
 
 
430 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  33.1 
 
 
424 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  31.9 
 
 
432 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  32.07 
 
 
431 aa  209  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  32.86 
 
 
432 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  32.3 
 
 
431 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  32.71 
 
 
430 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  32.86 
 
 
444 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  32.69 
 
 
416 aa  207  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  32.71 
 
 
430 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  32.07 
 
 
431 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  32.07 
 
 
431 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  32.07 
 
 
431 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 
432 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  32.15 
 
 
431 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  32.07 
 
 
431 aa  206  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  32.79 
 
 
432 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  33.18 
 
 
430 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  32.39 
 
 
427 aa  205  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  32.94 
 
 
457 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  32.79 
 
 
437 aa  205  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  32.62 
 
 
435 aa  205  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 
431 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  33.49 
 
 
426 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  32.3 
 
 
431 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  33.02 
 
 
432 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  32.63 
 
 
447 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
427 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  32.39 
 
 
431 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  30.21 
 
 
428 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 
431 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 
427 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  34.04 
 
 
423 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  31.13 
 
 
430 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 
432 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 
431 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 
431 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 
431 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 
432 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 
432 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  32.38 
 
 
435 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  31.83 
 
 
431 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  31.21 
 
 
430 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 
431 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 
423 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  32.39 
 
 
427 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 
427 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 
451 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  31.53 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  31.44 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  31.44 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  33.41 
 
 
430 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  32.63 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  30.99 
 
 
431 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  31.94 
 
 
437 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  31.76 
 
 
427 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  31.69 
 
 
432 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>