More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0028 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 
438 aa  691    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 
438 aa  689    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
438 aa  910    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  73.06 
 
 
438 aa  690    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  73.74 
 
 
438 aa  696    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
434 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
444 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
443 aa  498  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
428 aa  495  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
429 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
430 aa  497  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 
430 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
434 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
434 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
432 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
434 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
429 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
429 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
436 aa  378  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
428 aa  366  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
429 aa  368  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
429 aa  368  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
428 aa  362  6e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
428 aa  361  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
432 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
432 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
432 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
432 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
432 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
432 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
432 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
434 aa  322  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
423 aa  317  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
433 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
430 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
430 aa  280  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
573 aa  277  3e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  35.29 
 
 
428 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
436 aa  275  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
445 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.35 
 
 
441 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.71 
 
 
430 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
434 aa  267  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
430 aa  266  5.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  35 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
441 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
431 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  33.26 
 
 
567 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  37.64 
 
 
447 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
441 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
424 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  32.97 
 
 
956 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
435 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
431 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
440 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  33.48 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
442 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
432 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
431 aa  249  8e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
431 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
429 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
432 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  32.19 
 
 
437 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
432 aa  247  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
433 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  31.84 
 
 
579 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
430 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  36.01 
 
 
884 aa  243  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
434 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
434 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
434 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  32.16 
 
 
460 aa  233  6e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
434 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
434 aa  229  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
449 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
430 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
447 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  31.79 
 
 
555 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  31.24 
 
 
553 aa  209  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>