186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0024 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  100 
 
 
123 aa  248  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  62.1 
 
 
124 aa  155  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  55.65 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  54.03 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  54.03 
 
 
126 aa  137  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.79 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.4 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.02 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.5 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.83 
 
 
117 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.17 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.23 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.27 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  32.35 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  32.5 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.79 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.43 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.43 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.43 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2541  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  31.67 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.17 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.61 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.5 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.07 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.45 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.46 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.75 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.17 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.93 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.03 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.67 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.03 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.46 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3391  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  29.31 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.440327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.7 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.59 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3317  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  29.31 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000010148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3492  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.919493  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3397  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3326  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  29.31 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651376  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.83 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.04 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.03 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  27.87 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0331  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.17 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0315757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.33 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.23 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7256  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.17 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492993  normal  0.319933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.33 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  30.65 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.83 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.51 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2444  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.46 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1964  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.27 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.2 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.17 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50490  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  30.84 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00363931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.46 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.64 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  29.91 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.7 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.17 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.3 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.64 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.15 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.83 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1159  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.31 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.23 
 
 
114 aa  57  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.72 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.69 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.58 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.03 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.46 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0705  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.45 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3418  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0702  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3171  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02867  HybF  28.45 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.17 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  27.83 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0730  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.06 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.525466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.17 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.17 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.76 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.76 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.83 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3277  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.17 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.59 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02816  hypothetical protein  28.45 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4303  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236988  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3460  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  28.45 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.06 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.57 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>