More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0020 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  712    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  80.35 
 
 
349 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  78.61 
 
 
349 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  80.06 
 
 
349 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  79.19 
 
 
349 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  66.67 
 
 
349 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  62.82 
 
 
349 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  63.9 
 
 
350 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  63.32 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  62.57 
 
 
347 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  63.51 
 
 
347 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  63.61 
 
 
350 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  60.06 
 
 
345 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  65.62 
 
 
350 aa  408  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  54.05 
 
 
349 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  52.74 
 
 
350 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  51.3 
 
 
350 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  53.01 
 
 
349 aa  369  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  52.33 
 
 
348 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  52.77 
 
 
346 aa  362  8e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  50.29 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  51.59 
 
 
351 aa  348  6e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  50.87 
 
 
348 aa  338  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  50.29 
 
 
348 aa  332  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.29 
 
 
350 aa  328  6e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  45.75 
 
 
348 aa  311  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  26.09 
 
 
481 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  24.71 
 
 
490 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.61 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 
913 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  26.49 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  26.21 
 
 
502 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  24.86 
 
 
474 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  24.65 
 
 
485 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.77 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.94 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.94 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.15 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.51 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.51 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.41 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.76 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  25.29 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.4 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.32 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.68 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.04 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.45 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.6 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1593  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.05 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  25.51 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.15 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  25.64 
 
 
495 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.62 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.68 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.68 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.27 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  23.97 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  23.49 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.29 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.68 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.76 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51390  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.46 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.05 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  25.23 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  22.56 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.68 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00208212  normal  0.0221839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.58 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  24.48 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.57 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.1 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  22.68 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3556  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  22.4 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.896137  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.03 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5526  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.56 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.386832  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.05 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.48 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.44 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.33 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0762403  normal  0.118636 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0448  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.95 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0646  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.64 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1605  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.36 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4399  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.25 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  23.55 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.35 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.16 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0148108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.78 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2467  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.32 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000376191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0982  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.16 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000366102  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2221  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.94 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.00000055918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1667  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  22.53 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.05 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>