29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0019 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  67.25 
 
 		 229 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  67.25 
 
 		 229 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  68.56 
 
 		 229 aa  330  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  67.25 
 
 		 229 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  47.58 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 		 237 aa  185  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.72 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  39.41 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  37.45 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  40.77 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  39.57 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  38.22 
 
 		 236 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  37.89 
 
 		 235 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  36.91 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  36.24 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 67 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 271 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>