276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0014 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  74.47 
 
 
425 aa  649    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  100 
 
 
425 aa  856    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  74.06 
 
 
425 aa  651    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  73.35 
 
 
425 aa  645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  73.82 
 
 
425 aa  645    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  45.94 
 
 
421 aa  333  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  45.27 
 
 
425 aa  332  9e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  40.28 
 
 
433 aa  323  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0122  UbiD family decarboxylase  43.67 
 
 
413 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.695479  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2139  UbiD family decarboxylase  42.93 
 
 
413 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  51.22 
 
 
412 aa  299  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0510  UbiD family decarboxylase  43 
 
 
412 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2438  carboxylyase-like protein  46.04 
 
 
413 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1397  UbiD family decarboxylase  37.94 
 
 
424 aa  276  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0856  UbiD family decarboxylase  38.12 
 
 
424 aa  276  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0940  UbiD family decarboxylase  40.63 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0767  UbiD family decarboxylase  42.24 
 
 
411 aa  273  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0948  UbiD family decarboxylase  39.07 
 
 
425 aa  268  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  37.8 
 
 
469 aa  264  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  36.76 
 
 
443 aa  263  4e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0422  UbiD family decarboxylase  43.47 
 
 
440 aa  259  6e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.586666  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1921  UbiD family decarboxylase  37.44 
 
 
425 aa  256  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  39.9 
 
 
450 aa  248  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  36.34 
 
 
472 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  36.61 
 
 
494 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  36.82 
 
 
494 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  36.53 
 
 
506 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  34.81 
 
 
469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  35.31 
 
 
462 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  36.1 
 
 
461 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  30.39 
 
 
443 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  31.24 
 
 
463 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  29.55 
 
 
443 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  28.79 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  33.43 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  29.32 
 
 
464 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  30.05 
 
 
461 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3679  Carboxylyase-related protein  30.15 
 
 
485 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  33.72 
 
 
531 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  32.62 
 
 
504 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  28.68 
 
 
464 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.36 
 
 
492 aa  148  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  31.63 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  29.38 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.46 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  32.81 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  24.88 
 
 
480 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  32.09 
 
 
502 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  32.09 
 
 
502 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  31.02 
 
 
462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  30.77 
 
 
502 aa  146  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.44 
 
 
502 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  28.46 
 
 
474 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.55 
 
 
521 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.12 
 
 
506 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  25.85 
 
 
527 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  29.1 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  25.46 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.05 
 
 
525 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  28.57 
 
 
520 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.67 
 
 
520 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  28.19 
 
 
480 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.35 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2388  UbiD family decarboxylase  26.51 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.0671796 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.75 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.28 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  29.79 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  29.18 
 
 
487 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.75 
 
 
490 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  31.19 
 
 
488 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  28.79 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.6 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.14 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.14 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  28.44 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.82 
 
 
497 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.21 
 
 
495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.89 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  28.74 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6296  UbiD family decarboxylase  28.53 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.59 
 
 
506 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.53 
 
 
497 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.91 
 
 
506 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.91 
 
 
498 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  30.3 
 
 
491 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.53 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  28.66 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  29.31 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.15 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  28.53 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  29.43 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2119  UbiD family decarboxylase  26.67 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381426  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  29.01 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.53 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.53 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>