More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA_tRNA-Ile-1 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000168156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0011  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0062166  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000846583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000136136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0043  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0012  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.430923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0028  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  hitchhiker  0.002006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna57  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000350129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0028  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0088  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156507  normal  0.184684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0080  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0033  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.715295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0052  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.307306  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0071  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0028  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0012  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  0.23369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0009  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102248  normal  0.0119324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0007  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0035  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0004  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000767494  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0014  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0041  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0027  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0020  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0043  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0060  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna50  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000949027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0035  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0021  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0014  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0083  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000277539  normal  0.33634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0041  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.018808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0022  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0042  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0053  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0036  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0067  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0634109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0020  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0050  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0022  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.983676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0001  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0032  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000441039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0007  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0019  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.522587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6152  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718757  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0064  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t15  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t42  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t63  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt40  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt40  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA14  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0900551  normal  0.0100999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA5  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA51  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000929539  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0049  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.319822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000836991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0086  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00068353  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5402  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0831781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>