63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0747 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mflt018  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0747  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0055  tRNA-Asp  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  88.16 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0046  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14012  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2553699999999997e-37  hitchhiker  0.00000344638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0016  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0045  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0051  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0046  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923307  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0049  tRNA-Asp  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0020  tRNA-Asp  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06170  tRNA-Asp  90.57 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.58434  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1597  tRNA-Asp  97.14 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287009  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1571  tRNA-Asp  97.06 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1606  tRNA-Asp  97.06 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.847365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  96.88 
 
 
75 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  88.24 
 
 
78 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0076  tRNA-Asp  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37120  tRNA-Asp  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176209  normal  0.041751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0038  tRNA-Asp  93.94 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0045  tRNA-Asp  93.94 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0088  tRNA-Asp  93.94 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  90 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  86.27 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  84.13 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1400  tRNA-Asp  84.13 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.754313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>