More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0696 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  80.09 
 
 
238 aa  360  1e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.49955e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  57.92 
 
 
228 aa  253  2e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  57.55 
 
 
211 aa  252  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  61.27 
 
 
247 aa  251  4e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.58145e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  59.33 
 
 
211 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  58.74 
 
 
210 aa  243  2e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  58.82 
 
 
208 aa  240  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  54.13 
 
 
219 aa  239  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.63613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 
210 aa  239  3e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  56.56 
 
 
272 aa  238  4e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  59.3 
 
 
213 aa  238  7e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  57.35 
 
 
208 aa  237  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 
210 aa  237  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 
210 aa  237  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55.87 
 
 
209 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 
211 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 
209 aa  222  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.00637e-07  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 
220 aa  219  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.23614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  51.16 
 
 
220 aa  218  4e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
210 aa  218  4e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
209 aa  217  9e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
209 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  51.16 
 
 
220 aa  215  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.05261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
213 aa  214  1e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
210 aa  214  1e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
212 aa  213  2e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
209 aa  211  5e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
209 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 
211 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
209 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
209 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
210 aa  200  2e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 
212 aa  199  2e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
212 aa  197  8e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 
217 aa  197  1e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
206 aa  193  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  47.16 
 
 
233 aa  191  7e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  47.62 
 
 
215 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  46.48 
 
 
213 aa  189  3e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
214 aa  188  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.7151e-11  hitchhiker  1.66028e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 
210 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.81863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 
210 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.02 
 
 
209 aa  185  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  44.86 
 
 
222 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0477  ribosomal protein L3  42.04 
 
 
245 aa  184  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  47.37 
 
 
216 aa  184  1e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
212 aa  183  2e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.66431e-08  unclonable  2.47869e-08 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 
207 aa  183  2e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 
212 aa  183  2e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.26152e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 
207 aa  183  2e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  48.76 
 
 
206 aa  182  4e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  47.22 
 
 
213 aa  182  4e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
212 aa  182  5e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.06645e-07  decreased coverage  4.70561e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  49.28 
 
 
214 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
216 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 
210 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.31463e-05  hitchhiker  3.31617e-13 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 
208 aa  181  9e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 
212 aa  181  9e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  43.28 
 
 
206 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  47.85 
 
 
209 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 
207 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  44.61 
 
 
211 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  45.71 
 
 
219 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
209 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
211 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
212 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.15109e-07  unclonable  5.79905e-11 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
216 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
207 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.58376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 
210 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  4.71094e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 
210 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
218 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
208 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.58228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 
205 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  6.60439e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 
212 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  46.67 
 
 
215 aa  178  6e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
209 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
209 aa  178  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  47.17 
 
 
218 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 
218 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 
212 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.99127e-06  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0200  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.46138e-08  unclonable  9.36811e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4170  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.00962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.58076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0196  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.33275e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4056  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.39517e-08  hitchhiker  1.8898e-10 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  45.45 
 
 
209 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0199  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.36858e-07  unclonable  1.96513e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0231  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0194  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000648086  decreased coverage  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0199  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
212 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.0724e-08  hitchhiker  1.9855e-09 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.76 
 
 
219 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
212 aa  175  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  8.08775e-12  hitchhiker  3.19768e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>