More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0695 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  78.85 
 
 
208 aa  347  8e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 
207 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 
207 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 
207 aa  212  3e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 
207 aa  212  4e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 
207 aa  208  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 
207 aa  207  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 
207 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 
207 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  49.02 
 
 
206 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  51.47 
 
 
207 aa  201  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 
206 aa  200  1e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 
208 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 
208 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  50.48 
 
 
207 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 
208 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 
206 aa  196  1e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  50.49 
 
 
206 aa  196  2e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 
207 aa  195  4e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 
207 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.84788e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 
207 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 
205 aa  191  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  46.57 
 
 
207 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 
206 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  44.66 
 
 
223 aa  189  3e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 
204 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 
208 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  43.96 
 
 
207 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 
204 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  46.82 
 
 
221 aa  185  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  48.02 
 
 
209 aa  185  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 
207 aa  183  2e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  45.37 
 
 
207 aa  182  4e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0227  50S ribosomal protein L4  43.72 
 
 
211 aa  172  2e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.63 
 
 
207 aa  172  3e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.9 
 
 
207 aa  172  3e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  43.44 
 
 
223 aa  170  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  42.51 
 
 
223 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  40.38 
 
 
207 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 
208 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  43.96 
 
 
207 aa  168  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
208 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 
209 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 
208 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.69782e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 
211 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  43.27 
 
 
209 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 
208 aa  166  3e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  42.03 
 
 
221 aa  166  3e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 
208 aa  164  6e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  45.6 
 
 
206 aa  164  7e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 
212 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  41.43 
 
 
222 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  40.1 
 
 
208 aa  162  4e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.38717e-07  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  42.58 
 
 
209 aa  161  5e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 
208 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  38.99 
 
 
221 aa  161  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  41.67 
 
 
210 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
207 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 
212 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 
211 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.72 
 
 
207 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 
208 aa  159  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.40203e-05  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 
210 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  44.69 
 
 
210 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 
210 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  2.05733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 
208 aa  157  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.72 
 
 
207 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 
209 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 
210 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 
209 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 
206 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.29639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 
211 aa  154  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 
212 aa  154  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 
206 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  47.19 
 
 
211 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 
206 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  38.46 
 
 
210 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 
210 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 
210 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 
220 aa  152  3e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.30014e-06  hitchhiker  3.1805e-13 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  39.05 
 
 
214 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 
209 aa  152  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  6.71055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  41.35 
 
 
207 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 
207 aa  150  9e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 
211 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 
209 aa  150  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 
209 aa  150  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  41.63 
 
 
212 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>