More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0687 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  88.24 
 
 
85 aa  157  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  73.81 
 
 
87 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  75 
 
 
87 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  70.59 
 
 
86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  71.76 
 
 
86 aa  128  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  72.62 
 
 
88 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  123  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 
87 aa  123  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  69.05 
 
 
87 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
87 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  67.06 
 
 
86 aa  120  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 
88 aa  120  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  68.67 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0205  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 
88 aa  117  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  65.88 
 
 
86 aa  108  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 
89 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  63.86 
 
 
84 aa  103  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 
84 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 
84 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  61.45 
 
 
86 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
99 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  55.29 
 
 
86 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 
94 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
86 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  56.63 
 
 
86 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  57.83 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  60.24 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  62.67 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  62.67 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0235  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 
86 aa  96.7  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  56.1 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3329  30S ribosomal protein S17  57.5 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000398832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  56.47 
 
 
85 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0990  ribosomal protein S17  60.24 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.788339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
87 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  56.79 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  59.49 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  51.22 
 
 
87 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
107 aa  94  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  49.41 
 
 
85 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 
94 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 
84 aa  93.6  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  57.5 
 
 
84 aa  93.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
96 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0498  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 
84 aa  93.6  9e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  58.97 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  53.66 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  57.89 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  59.74 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  59.74 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  59.26 
 
 
93 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 
88 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 
99 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
90 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3990  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
90 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
90 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  60.26 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>