More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0672 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  167  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  64.84 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 115 aa  160  8.000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  156  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 124 aa  156  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  60.33 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 118 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0180  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000423158  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0235  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000771174  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  59.84 
 
 		 122 aa  147  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001720  SSU ribosomal protein S13p (S18e)  56.9 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000208001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2152  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000893121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  53.45 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0206  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000458575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  52.5 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0341  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000179312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.31 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3781  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000117376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4620  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000695624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3492  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3593  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00190616  normal  0.0522368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>