More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0662 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  86.82 
 
 
131 aa  216  6e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  157  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  156  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  60.94 
 
 
131 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  60.94 
 
 
131 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
133 aa  155  3e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  58.27 
 
 
131 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 
130 aa  146  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  61.72 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
130 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  57.81 
 
 
130 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
132 aa  140  6e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  54.4 
 
 
264 aa  137  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  53.91 
 
 
131 aa  135  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  53.03 
 
 
131 aa  136  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.47 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  134  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  133  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  53.91 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  48.87 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  53.12 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  52.31 
 
 
132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  55.81 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 
134 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  49.24 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  52.34 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  54.2 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  52.34 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  128  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  50 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  48.48 
 
 
136 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  51.22 
 
 
170 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  48.48 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  56.35 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  52.07 
 
 
174 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
138 aa  126  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  51.91 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  49.61 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  52.55 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  52.55 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  52.31 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
137 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1102  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
135 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 
172 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 
132 aa  124  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  47.37 
 
 
136 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19771  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
135 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>