More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0547 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  81.4 
 
 
89 aa  155  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  61.36 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  60 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  60 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  53.41 
 
 
91 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  51.09 
 
 
95 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  51.09 
 
 
95 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  57.3 
 
 
91 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  55.06 
 
 
91 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  55.06 
 
 
91 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 
81 aa  103  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 
81 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  50.57 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  50.57 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 
81 aa  95.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 
81 aa  95.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
183 aa  94.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  53.66 
 
 
191 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  47.06 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 
86 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  56.96 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  48.84 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  49.41 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
188 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  51.22 
 
 
146 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  45.56 
 
 
195 aa  89.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  45.65 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55.26 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55.26 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  53.16 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  39.64 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  46.07 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.9 
 
 
81 aa  85.9  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  46.51 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.15 
 
 
204 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  49.38 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  51.95 
 
 
82 aa  84.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  52.7 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
192 aa  84  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  56 
 
 
79 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 
130 aa  83.6  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  40.62 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  54.05 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  45.98 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000617647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  44 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  41.05 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  50 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.0000270999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  46.84 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  47.67 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  46.84 
 
 
82 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>