More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0517 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  100 
 
 		 428 aa  839    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  54.1 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.49 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.29 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.07 
 
 		 428 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  30.46 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  33.01 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.92 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  33.58 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.12 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  32.84 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  32.24 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  33.84 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  34.17 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  34.61 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  34.84 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  32.3 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.62 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.58 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.07 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.07 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  32.07 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  32.84 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  32.84 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.6 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.83 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  32.68 
 
 		 427 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.95 
 
 		 446 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.6 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  33.96 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  32.99 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.1 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.79 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  30.79 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.31 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  27.05 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  30.94 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.38 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.72 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  27.21 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.77 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.07 
 
 		 433 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.85 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  34.8 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  28.77 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  27.06 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  27.54 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  32.55 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.47 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  28.57 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  33.92 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.81 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  28.04 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  27.97 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  28.4 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.88 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  28.07 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  28.4 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  30.03 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  28.47 
 
 		 448 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.72 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  28.4 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  26.52 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  29.23 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.47 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.57 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  28.64 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  29.13 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  28.69 
 
 		 460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  28.87 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  28.87 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  28.87 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  28.87 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  28.87 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  26.91 
 
 		 442 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.02 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  28.4 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  28.4 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  25.63 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  28.11 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  28.61 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>