80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0506 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 249 aa  482  1e-135  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  32.22 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  27.5 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  22.05 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  22.44 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  27.66 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  18.94 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  24.31 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.49 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  22.98 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  24.19 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  23.08 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  20.47 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  16.37 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  21.55 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  19.71 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  17.7 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  22.5 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  18.6 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  18.6 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  18.6 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  22.35 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  18.63 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  22.08 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.63 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  19.89 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  19.66 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  20.5 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  18.54 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  22.31 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  20.56 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  17.17 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  20.56 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  20.56 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  22.6 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  24.5 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  17.07 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  22.65 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  20.36 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  17.33 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  21.11 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  18.89 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  23.88 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  23.91 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  17.33 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  26.04 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  18.87 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  24.86 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  25.16 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  21.6 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  23.97 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  17.75 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf127  recombinational DNA repair protein O  32.1 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  30.28 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  16.83 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  19.1 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  23.97 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  19.51 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  23.78 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  25.14 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  23.17 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>