195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0452 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0452  glycerol ABC transporter, permease  100 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00260112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.06 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0906  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  23.17 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100399  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  22.62 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  25.35 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  22.14 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.72 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  22.1 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 
312 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.06 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  23.68 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  20.56 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  23.77 
 
 
281 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.05 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  28.42 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.08 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0770024  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.15 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316897  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.22 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.5 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.13 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.66 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.25 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.500307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.44 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.96 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1599  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.58 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.955458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  20.31 
 
 
283 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.65 
 
 
271 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  23.65 
 
 
271 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  22.93 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.61 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.62 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.5 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  24.71 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.69 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.88 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1640  ABC-type maltose transport system, permease component  22.52 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000193364  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.62 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.25 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.67 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.980821  normal  0.149649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.08 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.72 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  24.23 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.57 
 
 
277 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.6 
 
 
290 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.46 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.64 
 
 
307 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.21 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.62 
 
 
303 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.34 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  23.68 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5407  ABC transporter sugar permease  23.6 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.04 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5822  putative sugar uptake ABC transporter permease protein  22.85 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  19.54 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.22 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15080  ABC-type sugar transport system, permease component  23.66 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  19.77 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5004  sugar ABC transporter permease  24.06 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0638088  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0738  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.88 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.93 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  20.46 
 
 
273 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.97 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27710  ABC-type sugar transport system, permease component  23.56 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal  0.331014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5710  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  22.75 
 
 
280 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.3 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.61 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.07 
 
 
287 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  23.38 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  24.76 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  22.56 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  21.48 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.76 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01230  ABC-type sugar transport system, permease component  24 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
324 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1058  MalG-type ABC sugar transport system permease component  21.76 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.97 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.61 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1938  putative permease protein of sugar ABC transporter  22.73 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.9 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.92 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>