More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0414 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 93 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  87.91 
 
 		 95 aa  165  2e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 96 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  76.14 
 
 		 96 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  71.59 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  73.26 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  72.09 
 
 		 92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  66.3 
 
 		 99 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  61.96 
 
 		 96 aa  120  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  57.78 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 92 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  61.29 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.04 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  103  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 92 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  62.22 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  96.7  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  55.42 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  59.04 
 
 		 84 aa  94.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  61.9 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>