More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0324 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 414 aa  836    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 419 aa  323  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 423 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 423 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 426 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 400 aa  289  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 421 aa  278  9e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  36.84 
 
 		 422 aa  272  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 424 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 419 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 424 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 424 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 429 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 429 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  34.74 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 422 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 424 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 422 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>