69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0301 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 818 aa  1636    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  27.26 
 
 		 955 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  28.41 
 
 		 945 aa  155  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  25.7 
 
 		 610 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  21.71 
 
 		 644 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.3 
 
 		 609 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  22.43 
 
 		 645 aa  105  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  24.61 
 
 		 610 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.42 
 
 		 621 aa  90.5  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.04 
 
 		 866 aa  88.6  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.81 
 
 		 659 aa  85.5  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  21.01 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.19 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.89 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  22.44 
 
 		 1085 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.32 
 
 		 608 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  21.88 
 
 		 875 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.38 
 
 		 629 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.08 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  21.94 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.94 
 
 		 1043 aa  64.7  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  24.35 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  21.1 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  29.75 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  23.01 
 
 		 699 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  25.31 
 
 		 696 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  22.22 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  22.89 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  22.89 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.04 
 
 		 792 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  24.92 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  21.62 
 
 		 893 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.57 
 
 		 630 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.89 
 
 		 815 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  22.08 
 
 		 690 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.63 
 
 		 631 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  21.58 
 
 		 866 aa  54.7  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.73 
 
 		 515 aa  54.3  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  20.68 
 
 		 827 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  32.94 
 
 		 908 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  26.99 
 
 		 948 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  28 
 
 		 941 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  21.5 
 
 		 865 aa  51.6  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  25.53 
 
 		 240 aa  50.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  20.59 
 
 		 952 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  20.35 
 
 		 500 aa  50.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  28.83 
 
 		 505 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  28.46 
 
 		 917 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.66 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  25.61 
 
 		 954 aa  48.9  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.23 
 
 		 696 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  25.61 
 
 		 954 aa  48.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  20.5 
 
 		 516 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  20.8 
 
 		 847 aa  47.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1042 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.22 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  26.89 
 
 		 495 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  27.69 
 
 		 913 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  22.66 
 
 		 502 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.69 
 
 		 913 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  25.86 
 
 		 512 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1002 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  26.05 
 
 		 495 aa  45.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  22.62 
 
 		 908 aa  45.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  20.94 
 
 		 866 aa  45.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  28.67 
 
 		 964 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.12 
 
 		 802 aa  44.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.6 
 
 		 861 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  26.98 
 
 		 955 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>