More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0258 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 909 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 880 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 879 aa  710    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 876 aa  879    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 881 aa  861    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 883 aa  828    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 865 aa  663    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 880 aa  881    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 881 aa  866    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 881 aa  867    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl355  valyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 873 aa  1128    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.473625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 881 aa  866    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 880 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 874 aa  737    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 881 aa  865    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 881 aa  681    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 881 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 881 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 885 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 882 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 865 aa  653    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0263  valyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 874 aa  782    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 879 aa  721    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 881 aa  866    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 880 aa  877    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 909 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0258  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 872 aa  1781    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 880 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 881 aa  862    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 881 aa  701    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 876 aa  882    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 881 aa  865    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 884 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 866 aa  654    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 922 aa  642    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 881 aa  866    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 900 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf019  fusion of oligopeptide transport protein OppF and Valyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 1631 aa  639    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 880 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 880 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 876 aa  882    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 881 aa  859    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 885 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 883 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 880 aa  646    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 881 aa  858    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 880 aa  808    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 902 aa  778    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 879 aa  850    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 894 aa  795    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 883 aa  830    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 892 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 883 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 882 aa  713    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 884 aa  843    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 879 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 897 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 884 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 883 aa  635  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 891 aa  635  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 874 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 883 aa  633  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 924 aa  630  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 867 aa  631  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 917 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 888 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 929 aa  625  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 1006 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 883 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 886 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 888 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 876 aa  628  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 933 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 907 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 882 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 904 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 1002 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 914 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 926 aa  623  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 883 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 922 aa  625  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 943 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 883 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 874 aa  624  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 911 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 893 aa  622  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 892 aa  625  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 883 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0484  valyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 925 aa  621  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.762053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 921 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 921 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 918 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 917 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 895 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4240  valyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 948 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 897 aa  619  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 947 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 877 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 		 888 aa  616  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>