87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0242 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0242  putative lipoprotein  100 
 
 
762 aa  1467    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0120138  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  43.9 
 
 
913 aa  105  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  36.56 
 
 
467 aa  102  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  32.11 
 
 
497 aa  92.4  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  31.15 
 
 
509 aa  91.7  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  32.85 
 
 
300 aa  89.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  31.09 
 
 
250 aa  89.4  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  28.1 
 
 
414 aa  86.7  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  30.57 
 
 
250 aa  82.4  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  29.19 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  32.08 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  34.33 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  32.08 
 
 
226 aa  79.3  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  34.43 
 
 
182 aa  79.3  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  28.57 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  33.5 
 
 
228 aa  79.3  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  27.47 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  31.58 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  31.25 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  34.43 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  32.48 
 
 
2415 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  35.77 
 
 
181 aa  75.9  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  31.79 
 
 
934 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  32.22 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  31.69 
 
 
907 aa  72  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  36.29 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  30.32 
 
 
1038 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0177  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  70.1  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  30.66 
 
 
2670 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  24.81 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  34.51 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  26.04 
 
 
521 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  35 
 
 
415 aa  65.5  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  29.68 
 
 
898 aa  65.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0212  putative lipoprotein  33.64 
 
 
265 aa  65.1  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  30.28 
 
 
647 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  30.82 
 
 
634 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  30.06 
 
 
862 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0211  putative lipoprotein  34.31 
 
 
269 aa  62.8  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  31.21 
 
 
395 aa  62.4  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  29.5 
 
 
3060 aa  62  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  29.11 
 
 
762 aa  61.6  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  31.85 
 
 
741 aa  61.2  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  26.81 
 
 
253 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  28.37 
 
 
369 aa  60.5  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  33.09 
 
 
609 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  27.89 
 
 
423 aa  59.3  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  27.91 
 
 
982 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  23.12 
 
 
446 aa  58.5  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  28.57 
 
 
933 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  32.19 
 
 
857 aa  57.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  31.45 
 
 
321 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  31.79 
 
 
774 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  26 
 
 
427 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  30.86 
 
 
486 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  18.61 
 
 
3608 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  29.66 
 
 
413 aa  55.8  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  27.52 
 
 
331 aa  55.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  29.49 
 
 
500 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  26.45 
 
 
754 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  33.33 
 
 
560 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.19 
 
 
1227 aa  53.9  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  33.7 
 
 
496 aa  53.9  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  27.74 
 
 
204 aa  52.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  26.09 
 
 
800 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  29.19 
 
 
257 aa  52  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  30.6 
 
 
862 aa  52.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  27.92 
 
 
450 aa  52  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  30 
 
 
1621 aa  50.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  24.54 
 
 
324 aa  50.4  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  28.47 
 
 
275 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  27.91 
 
 
452 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  28.19 
 
 
789 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  33.63 
 
 
1214 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  26.95 
 
 
399 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  26.49 
 
 
200 aa  48.5  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  28.47 
 
 
414 aa  48.5  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  27.39 
 
 
173 aa  48.5  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  28.82 
 
 
451 aa  47.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  51.22 
 
 
95 aa  47.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  27.96 
 
 
658 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  25.41 
 
 
1575 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  35.56 
 
 
219 aa  45.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  28.45 
 
 
288 aa  45.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 
1175 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1850  hypothetical protein  32.8 
 
 
451 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  28.85 
 
 
180 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>