More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0210 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 		 598 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl469  GTP-binding membrane protein, elongation factor  80.72 
 
 		 612 aa  994    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000135836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 		 601 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 601 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53.96 
 
 		 602 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 600 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 598 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0210  GTP-binding protein TypA/BipA  100 
 
 		 609 aa  1231    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.486829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  53.97 
 
 		 604 aa  635    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 608 aa  658    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 		 601 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.72 
 
 		 603 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  53.53 
 
 		 615 aa  627  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 		 615 aa  627  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.62 
 
 		 614 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  52.81 
 
 		 602 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 606 aa  625  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  53.04 
 
 		 615 aa  621  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 602 aa  618  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 602 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  51.91 
 
 		 600 aa  617  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 		 602 aa  617  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 602 aa  618  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 		 602 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  52.75 
 
 		 610 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  53.08 
 
 		 609 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 607 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51.41 
 
 		 600 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 		 607 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  52.23 
 
 		 602 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 606 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  52.91 
 
 		 609 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 		 607 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  52.01 
 
 		 607 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 599 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 614 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 603 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  51.84 
 
 		 607 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  51.84 
 
 		 607 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  51.84 
 
 		 607 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 606 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  51.84 
 
 		 607 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  51 
 
 		 607 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 610 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 607 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 603 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  51.74 
 
 		 605 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 600 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 603 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  51.08 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 		 609 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  51 
 
 		 607 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.67 
 
 		 604 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 610 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  51 
 
 		 607 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  51 
 
 		 607 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  49.18 
 
 		 610 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 605 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 603 aa  601  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 623 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 608 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  51.09 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 603 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 609 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 605 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 609 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 603 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 603 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 603 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 603 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 608 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 607 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 603 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 605 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>