172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0204 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 63 aa  121  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  79.37 
 
 		 64 aa  98.2  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0206  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  51.79 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  37.93 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>