91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0173 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  85.26 
 
 
323 aa  149  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  70.53 
 
 
226 aa  141  2e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  69.66 
 
 
496 aa  131  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  64.21 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  64.21 
 
 
250 aa  118  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  64.29 
 
 
193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  65.48 
 
 
497 aa  114  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  52.5 
 
 
251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  58.51 
 
 
309 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  49.58 
 
 
250 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  57.89 
 
 
272 aa  105  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  57.89 
 
 
182 aa  102  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  49.58 
 
 
226 aa  97.8  4e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  68.57 
 
 
913 aa  97.1  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  49.17 
 
 
300 aa  94.7  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  54.67 
 
 
647 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  59.72 
 
 
754 aa  92.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  60 
 
 
800 aa  92.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  49.53 
 
 
371 aa  92.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  62.5 
 
 
609 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  58.11 
 
 
500 aa  89  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  57.14 
 
 
558 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  55.84 
 
 
331 aa  87.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  55.71 
 
 
2670 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  57.14 
 
 
427 aa  87  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  61.43 
 
 
741 aa  87  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  60 
 
 
857 aa  87.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  55.71 
 
 
1575 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  59.72 
 
 
486 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  60.56 
 
 
395 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  49.06 
 
 
228 aa  85.5  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0177  hypothetical protein  65.08 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  60 
 
 
862 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  60 
 
 
789 aa  82.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  50 
 
 
933 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  46.84 
 
 
2415 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  54.17 
 
 
898 aa  81.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  52.11 
 
 
862 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  54.17 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  46.74 
 
 
399 aa  78.2  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  52.86 
 
 
509 aa  78.6  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  54.17 
 
 
3060 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  55.71 
 
 
414 aa  78.6  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  48.57 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  54.17 
 
 
634 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  52.17 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  46.53 
 
 
190 aa  77  0.00000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  51.35 
 
 
560 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  48.61 
 
 
521 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  54.17 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  52.86 
 
 
1214 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  52.78 
 
 
774 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  52.78 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  48.61 
 
 
982 aa  75.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  59.02 
 
 
467 aa  75.5  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  44.66 
 
 
377 aa  75.1  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  45.83 
 
 
934 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  49.33 
 
 
253 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  45.56 
 
 
369 aa  74.3  0.0000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  55.71 
 
 
658 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  45.83 
 
 
1038 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  50.7 
 
 
181 aa  73.6  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  50.72 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  52.86 
 
 
762 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  39.05 
 
 
907 aa  72.8  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  45.07 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  48.57 
 
 
450 aa  71.6  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  52.38 
 
 
219 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  44.44 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  51.43 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  40.51 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0212  putative lipoprotein  55.17 
 
 
265 aa  67.8  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  44.29 
 
 
452 aa  67.8  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  42.7 
 
 
275 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  43.06 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  55.93 
 
 
423 aa  63.9  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  58 
 
 
446 aa  64.3  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  55.93 
 
 
413 aa  63.9  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  44.29 
 
 
236 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  53.03 
 
 
257 aa  63.9  0.0000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05062  hypothetical protein  48.15 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  40.26 
 
 
415 aa  56.2  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  45.78 
 
 
324 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0941  protein of unknown function DUF285 lipoprotein  43.33 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.885943  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0211  putative lipoprotein  43.86 
 
 
269 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.86 
 
 
1227 aa  50.1  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0242  putative lipoprotein  51.22 
 
 
762 aa  47.4  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0120138  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  41.94 
 
 
809 aa  47.4  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  40.98 
 
 
414 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  41.43 
 
 
2833 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>