More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0125 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  100 
 
 
408 aa  823  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  44.22 
 
 
403 aa  336  4e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  45.23 
 
 
401 aa  315  7e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  39.45 
 
 
405 aa  314  2e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.75 
 
 
404 aa  313  4e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.88 
 
 
404 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  40.84 
 
 
402 aa  308  2e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  40.67 
 
 
403 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  43.54 
 
 
402 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.37 
 
 
403 aa  303  3e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.65 
 
 
402 aa  302  7e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  43.8 
 
 
418 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.46 
 
 
403 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  39.95 
 
 
400 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.7 
 
 
403 aa  300  4e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  42.6 
 
 
395 aa  295  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  43.64 
 
 
402 aa  293  5e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40.4 
 
 
402 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  40.46 
 
 
403 aa  289  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  42 
 
 
401 aa  289  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  42 
 
 
401 aa  289  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  40.21 
 
 
403 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  38.85 
 
 
403 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  38.1 
 
 
403 aa  287  3e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  39.95 
 
 
403 aa  286  7e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  37.97 
 
 
403 aa  284  2e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  40.41 
 
 
403 aa  283  3e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  40.2 
 
 
403 aa  283  6e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  36.41 
 
 
402 aa  282  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  40.41 
 
 
403 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  41.58 
 
 
402 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.14 
 
 
408 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  42.86 
 
 
407 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  38.44 
 
 
403 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  40.56 
 
 
401 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  41.31 
 
 
413 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.43 
 
 
411 aa  275  1e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.07 
 
 
408 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  34.33 
 
 
415 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  39.53 
 
 
403 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  33.59 
 
 
402 aa  262  7e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  35.24 
 
 
406 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  39 
 
 
537 aa  260  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  39.6 
 
 
415 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.23756e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  44.88 
 
 
405 aa  259  9e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  38.96 
 
 
402 aa  258  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  36.2 
 
 
404 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  39.06 
 
 
406 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.07 
 
 
414 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  38.1 
 
 
410 aa  256  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  38.35 
 
 
411 aa  255  1e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  37.06 
 
 
410 aa  254  2e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.41 
 
 
403 aa  254  2e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  36.34 
 
 
401 aa  254  2e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  38.81 
 
 
403 aa  253  5e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  33.68 
 
 
412 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  41.32 
 
 
504 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  35.4 
 
 
404 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  37.5 
 
 
416 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  35.15 
 
 
402 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  35.04 
 
 
520 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  45.26 
 
 
346 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  45.26 
 
 
346 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  36.21 
 
 
403 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.49 
 
 
514 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  41.01 
 
 
504 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  37.62 
 
 
402 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  42.33 
 
 
358 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  35.88 
 
 
400 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  34.26 
 
 
403 aa  243  4e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  39.09 
 
 
416 aa  242  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.89 
 
 
320 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  35.56 
 
 
412 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  37.5 
 
 
403 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  34.88 
 
 
507 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  38.03 
 
 
403 aa  240  4e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  34 
 
 
412 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.04 
 
 
511 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  34.6 
 
 
509 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  45.03 
 
 
333 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37.46 
 
 
515 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  39.17 
 
 
421 aa  237  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  37.9 
 
 
509 aa  236  5e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  40.25 
 
 
501 aa  236  5e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  3.59898e-09 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  45.03 
 
 
333 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.36 
 
 
522 aa  236  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  44.41 
 
 
333 aa  235  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  37.39 
 
 
511 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  44.41 
 
 
333 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  44.41 
 
 
333 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  44.41 
 
 
333 aa  235  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  44.41 
 
 
333 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  37.69 
 
 
511 aa  235  1e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  35.04 
 
 
530 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  36.02 
 
 
403 aa  234  2e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  37.14 
 
 
515 aa  234  2e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  36.1 
 
 
511 aa  234  2e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  44.41 
 
 
333 aa  234  2e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  34.07 
 
 
405 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  37.04 
 
 
531 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>