More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0097 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl209  virulence associated protein, ribonuclease R  59.86 
 
 		 704 aa  865    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000726605  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0097  3'-5' exoribonuclease  100 
 
 		 704 aa  1404    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  33.64 
 
 		 806 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  33.49 
 
 		 806 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  33.49 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  33.49 
 
 		 804 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  33.49 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  34 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  31.8 
 
 		 792 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  33.06 
 
 		 774 aa  379  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  31.94 
 
 		 762 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  33.33 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  33.33 
 
 		 806 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  33.33 
 
 		 808 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  33.03 
 
 		 812 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  32.66 
 
 		 801 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  31.85 
 
 		 814 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  33.54 
 
 		 790 aa  364  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  33.54 
 
 		 790 aa  364  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  32.13 
 
 		 792 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  31.75 
 
 		 752 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  33.84 
 
 		 709 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  33.23 
 
 		 706 aa  352  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.69 
 
 		 759 aa  351  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  35.96 
 
 		 708 aa  348  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  33.29 
 
 		 788 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  33.23 
 
 		 726 aa  344  2.9999999999999997e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  30.25 
 
 		 715 aa  343  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  30.76 
 
 		 720 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  31.74 
 
 		 763 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  30.37 
 
 		 903 aa  340  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  33.95 
 
 		 706 aa  339  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  32.35 
 
 		 716 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  30.94 
 
 		 818 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  32.79 
 
 		 705 aa  339  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  32.9 
 
 		 751 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  32.05 
 
 		 817 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  30.3 
 
 		 763 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  33 
 
 		 751 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  35.06 
 
 		 779 aa  332  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  30.43 
 
 		 801 aa  331  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  30.04 
 
 		 736 aa  330  6e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  30.04 
 
 		 749 aa  330  6e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  33.43 
 
 		 694 aa  329  9e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  29.44 
 
 		 1055 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  30.03 
 
 		 910 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  33.54 
 
 		 757 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  32.04 
 
 		 751 aa  327  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  31.09 
 
 		 722 aa  327  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  30.8 
 
 		 858 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  28.74 
 
 		 746 aa  326  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  28.74 
 
 		 746 aa  326  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0063  ribonuclease R  33.38 
 
 		 721 aa  325  2e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  30.65 
 
 		 810 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  32.19 
 
 		 810 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  32.32 
 
 		 755 aa  323  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  30.08 
 
 		 857 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  30.5 
 
 		 857 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  32.49 
 
 		 710 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  32.94 
 
 		 710 aa  320  6e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  28.65 
 
 		 770 aa  320  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.76 
 
 		 777 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  29.69 
 
 		 813 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  31.13 
 
 		 804 aa  317  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  29.69 
 
 		 813 aa  316  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  29.69 
 
 		 813 aa  316  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  30.31 
 
 		 805 aa  316  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  29.69 
 
 		 813 aa  316  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  29.69 
 
 		 813 aa  316  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  29.69 
 
 		 813 aa  316  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  29.69 
 
 		 813 aa  316  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  30.43 
 
 		 880 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  28.84 
 
 		 870 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  31.02 
 
 		 714 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  29.2 
 
 		 876 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.69 
 
 		 813 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  29.55 
 
 		 813 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  34.99 
 
 		 695 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  31.66 
 
 		 726 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  28.51 
 
 		 758 aa  313  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  29.55 
 
 		 812 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  29.49 
 
 		 818 aa  313  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  29.55 
 
 		 812 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  29.55 
 
 		 812 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  29.55 
 
 		 812 aa  313  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  31.57 
 
 		 770 aa  313  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.22 
 
 		 735 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  29.42 
 
 		 812 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  29.8 
 
 		 844 aa  312  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  29.8 
 
 		 844 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.4 
 
 		 791 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  29.04 
 
 		 818 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  29.8 
 
 		 844 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  31.57 
 
 		 726 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  32.83 
 
 		 667 aa  312  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  32.39 
 
 		 718 aa  311  4e-83  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  29.11 
 
 		 824 aa  310  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  30.17 
 
 		 737 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  31.82 
 
 		 701 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  31.88 
 
 		 771 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>