More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0096 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0096  SsrA-binding protein  100 
 
 		 148 aa  289  9e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl210  SsrA-binding protein  64.86 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.021632  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  52.21 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  44.53 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  45 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 150 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 150 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0065  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.986546  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  43.62 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  42.28 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  40.14 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 172 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 155 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  40.85 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  42.75 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1018  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692219  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  40.88 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2057  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00464392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  41.13 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  45 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5309  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0732663  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2558  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2412  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6078  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1999  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1277  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.622701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 155 aa  126  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  37.76 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  42.03 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  42.07 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  39.72 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2032  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.148914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  41.43 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  43.07 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2435  SsrA-binding protein  41.43 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.0945366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  39.42 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  39.13 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4169  SsrA-binding protein  40.71 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.496394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  41.96 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  39.58 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  40.82 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>