More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0084 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 
472 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 
468 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
463 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.05 
 
 
458 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.77 
 
 
479 aa  805    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
473 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 
460 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 
460 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 
464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
470 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
476 aa  961    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.65 
 
 
503 aa  649    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
460 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  69.41 
 
 
467 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 
467 aa  646    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4090  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 
460 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
463 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
473 aa  653    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0144  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
464 aa  654    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.801647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 
463 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 
468 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.54 
 
 
465 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.54 
 
 
465 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 
460 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4255  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 
460 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.13 
 
 
462 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 
463 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4547  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.37 
 
 
460 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.49 
 
 
460 aa  634  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.3 
 
 
470 aa  631  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 
463 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.47 
 
 
462 aa  632  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.3 
 
 
462 aa  632  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.18 
 
 
458 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 
458 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5168  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.05631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3993  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 
460 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.91 
 
 
462 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 
463 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 
463 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  65.75 
 
 
479 aa  634  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
463 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
475 aa  632  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.3 
 
 
470 aa  631  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06104  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
461 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 
460 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
469 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
469 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
469 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
469 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
458 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2807  ATP synthase F1, beta subunit  65.58 
 
 
469 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.339111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
468 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.69 
 
 
482 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
469 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3203  ATP synthase F1, beta subunit  65.58 
 
 
469 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
460 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
468 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 
480 aa  630  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
466 aa  628  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.56 
 
 
462 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.43 
 
 
470 aa  625  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 
466 aa  625  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 
462 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  66.37 
 
 
465 aa  624  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 
481 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 
471 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 
466 aa  624  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
468 aa  624  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.32 
 
 
462 aa  626  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.94 
 
 
464 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
475 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.66 
 
 
509 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 
458 aa  621  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.15 
 
 
464 aa  621  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.96 
 
 
458 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
475 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  63.93 
 
 
501 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
474 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.24 
 
 
468 aa  621  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.26 
 
 
475 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 
476 aa  621  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.96 
 
 
457 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 
470 aa  621  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.09 
 
 
473 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>