More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0083 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0083  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
280 aa  560  1e-158  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl114  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.34 
 
 
281 aa  373  1e-102  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0145  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.25 
 
 
286 aa  181  1e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
282 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  33.91 
 
 
291 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0271  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.07 
 
 
294 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.05 
 
 
286 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.39 
 
 
281 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.16 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.16 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.16 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  30.39 
 
 
287 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  35.71 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.39 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 
287 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.1 
 
 
289 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  30.82 
 
 
287 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.85 
 
 
314 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.18 
 
 
293 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.85 
 
 
314 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 
287 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.4 
 
 
288 aa  159  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.69 
 
 
287 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  31 
 
 
286 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.78 
 
 
293 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31 
 
 
286 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 
315 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  31.54 
 
 
286 aa  158  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.53 
 
 
286 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.06 
 
 
286 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf047  ATP synthase gamma subunit  35.42 
 
 
291 aa  158  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.53 
 
 
286 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.76 
 
 
287 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.47 
 
 
286 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.65 
 
 
291 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.67 
 
 
286 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.6 
 
 
283 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.47 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.47 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.33 
 
 
315 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.99 
 
 
288 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.74 
 
 
287 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.99 
 
 
288 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.18 
 
 
286 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.51 
 
 
285 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
286 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.18 
 
 
286 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.56 
 
 
288 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.77 
 
 
286 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
293 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.77 
 
 
286 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.77 
 
 
286 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.58 
 
 
286 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.77 
 
 
286 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.65 
 
 
291 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.86 
 
 
287 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.36 
 
 
288 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.96 
 
 
293 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.58 
 
 
286 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  30 
 
 
289 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.23 
 
 
286 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.21 
 
 
290 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.9 
 
 
286 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.88 
 
 
286 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.23 
 
 
286 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.82 
 
 
289 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.36 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.77 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.17 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.96 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.5 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.23 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.14 
 
 
290 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.16 
 
 
285 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1425  ATP synthase F1, gamma subunit  34.52 
 
 
292 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.27 
 
 
291 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.58 
 
 
286 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.67 
 
 
287 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.54 
 
 
287 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  32.04 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  29.97 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  32.38 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  32.34 
 
 
309 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  32.47 
 
 
308 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.9 
 
 
286 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>