More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0067 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
165 aa  330  7.000000000000001e-90  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  78.05 
 
 
166 aa  264  4e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  43.42 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
166 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
166 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 
166 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.97 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
165 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
171 aa  110  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  38.27 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.09 
 
 
168 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.09 
 
 
168 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.35 
 
 
176 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  37.11 
 
 
182 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.14 
 
 
178 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf208  ribosomal protein L10  37.65 
 
 
165 aa  102  3e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  36.77 
 
 
174 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
174 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  37.01 
 
 
165 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
167 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
167 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
184 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
184 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
184 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
165 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
165 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.21 
 
 
175 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
165 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
165 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 
188 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.42 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  40.71 
 
 
182 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  39.71 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
215 aa  95.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  36.08 
 
 
174 aa  94  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  35 
 
 
179 aa  94  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  34.42 
 
 
197 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  33.99 
 
 
203 aa  92  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  37.27 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  34.64 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  34.67 
 
 
175 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  32.65 
 
 
200 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  34.84 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0010  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.76481  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  34.9 
 
 
174 aa  87.8  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  33.53 
 
 
176 aa  87.8  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  34.9 
 
 
174 aa  87.8  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 
183 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.65 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  31.48 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  34.84 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  32.26 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
177 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
228 aa  85.5  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  31.33 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  34.87 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 
175 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  31.52 
 
 
176 aa  84  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  32.19 
 
 
172 aa  84  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  36.02 
 
 
186 aa  84  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  36.23 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  32.43 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>