182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0060 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  100 
 
 		 289 aa  596  1e-169  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  55.82 
 
 		 293 aa  351  7e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  43.84 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  43.84 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  42.81 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  43.79 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  42.61 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  42.07 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  40.62 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  45.16 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  43.59 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  40.96 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  40.89 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  40.89 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  40.89 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  40.89 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  40.89 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  41.11 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  40.55 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  40.77 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  40.79 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  33.8 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  34.59 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  32.62 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  34.42 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  32.47 
 
 		 379 aa  145  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  34.87 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  30.8 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  29.75 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  35.19 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  31.32 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  34 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  33.2 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  31.7 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  32.96 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  32.83 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  29.7 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  32.52 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  32.71 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  31.07 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  33.96 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  33.5 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  29.64 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  31.11 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  30.92 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  29.78 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  30 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  28.21 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  32.2 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  30.77 
 
 		 544 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  30.56 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  29.56 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  31.86 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  31 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  28.52 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  28.52 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  32.83 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  28.25 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  30.39 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  30.45 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  29.55 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  27.99 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  27.68 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  28.52 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  28.52 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  28.52 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  28.52 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  28.52 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  28.52 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  29.58 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  30.94 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  30.43 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  29.56 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  27.68 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  29.1 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  30.85 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  28.79 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  28.79 
 
 		 285 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  28.79 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  32.86 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  27.31 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  27.76 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  30.15 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  28.79 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  28.14 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  29.85 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  27.64 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  28.78 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  29.09 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  33.17 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  29.67 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  29.04 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  28.41 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  29.04 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  27.64 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  28.14 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  26.84 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  30.24 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>