128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0049 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0049  DNA adenine methylase  100 
 
 		 325 aa  640    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  29.47 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  28.85 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  25.4 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  27.16 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  23.62 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  25.58 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  31.15 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  28.03 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  28.03 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0202  DNA adenine methylase  26.77 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  26.72 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  24.5 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  27.2 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  27.34 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.86 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  27.24 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2942  retron adenine methylase  22.78 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0304018  hitchhiker  1.0655700000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  25.08 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  26.97 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  26.62 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  24.19 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  25 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  26.32 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  25 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2236  DNA adenine methylase  25.97 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00406547  hitchhiker  0.0000680943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  25 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  25 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  24.1 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  26.78 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  26.42 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  20.47 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  24.07 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  26.81 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1136  DNA adenine methylase  23.92 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  26.82 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  24.62 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  24.22 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  25.88 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  24.34 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  24.34 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  24.34 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  24.34 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  24.34 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  23.72 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0166  DNA adenine methylase  25.22 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  24.16 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  22.85 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  23.66 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  25.08 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  24.81 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  23.83 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.14 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  26.39 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  23.37 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  25.86 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  24.79 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  25.86 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  25.86 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  27.86 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  24.81 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  22.63 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  27.83 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  22.75 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  26.77 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.61 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  23.77 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  25.59 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  25.15 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2890  DNA adenine methylase  25.51 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  27.27 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  25.74 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  23.87 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  22.98 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  23.36 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  25.26 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  24.9 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  24.91 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  24.11 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  24.9 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  24.57 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  21.01 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  26.91 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  24.07 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  26.43 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4539  DNA adenine methylase  23.11 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  25.32 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2876  retron adenine methylase  23.69 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.672134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>