More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0045 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  45.88 
 
 
834 aa  700    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  43.3 
 
 
888 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  41.61 
 
 
907 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  41.48 
 
 
907 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  43.04 
 
 
838 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  47.15 
 
 
844 aa  717    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  48.22 
 
 
843 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  43.79 
 
 
916 aa  662    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  40.61 
 
 
934 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  46.3 
 
 
835 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 
873 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 
842 aa  710    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  44.82 
 
 
787 aa  662    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  42.07 
 
 
954 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  42.29 
 
 
912 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  46.05 
 
 
835 aa  707    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  49.67 
 
 
837 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  46.05 
 
 
835 aa  707    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl057  preprotein translocase subunit SecA  66.42 
 
 
943 aa  1261    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  46.05 
 
 
835 aa  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  46.17 
 
 
835 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  42.37 
 
 
896 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 
896 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf154  preprotein translocase subunit SecA  48.32 
 
 
866 aa  695    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  48.16 
 
 
787 aa  725    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  45.92 
 
 
835 aa  706    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  42.31 
 
 
968 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  41.02 
 
 
924 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0134  preprotein translocase subunit SecA  46.7 
 
 
840 aa  665    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  41.84 
 
 
912 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.42 
 
 
886 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  41.54 
 
 
914 aa  656    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3049  preprotein translocase subunit SecA  44.18 
 
 
787 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  41.13 
 
 
897 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  39.91 
 
 
932 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.63 
 
 
864 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  45.92 
 
 
835 aa  705    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  46.05 
 
 
835 aa  707    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  40.14 
 
 
932 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0045  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
944 aa  1906    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  41.3 
 
 
914 aa  653    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  43.33 
 
 
896 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  42.21 
 
 
907 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  42.64 
 
 
872 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  40.64 
 
 
918 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  46.8 
 
 
836 aa  728    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  45.01 
 
 
824 aa  663    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  43.62 
 
 
897 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  42.63 
 
 
908 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  49.73 
 
 
837 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  45.92 
 
 
835 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  48.22 
 
 
843 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
858 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  40.79 
 
 
907 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  41.98 
 
 
909 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  44.12 
 
 
910 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  46.24 
 
 
840 aa  707    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  46.37 
 
 
845 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  46.37 
 
 
858 aa  677    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  43.01 
 
 
902 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  41.99 
 
 
910 aa  661    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  40.37 
 
 
931 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  41.19 
 
 
906 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  45.63 
 
 
830 aa  693    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  40.37 
 
 
931 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  46.98 
 
 
865 aa  709    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1321  protein translocase subunit secA  45.83 
 
 
788 aa  682    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 
799 aa  701    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0183  protein translocase subunit secA  45.75 
 
 
803 aa  659    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  47.38 
 
 
849 aa  716    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  46.17 
 
 
835 aa  709    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  43.88 
 
 
840 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  45.83 
 
 
859 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  46.61 
 
 
796 aa  707    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  44.67 
 
 
845 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  43.91 
 
 
913 aa  663    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  42.62 
 
 
833 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  45.75 
 
 
848 aa  681    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  41.61 
 
 
908 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  43.31 
 
 
890 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  42.75 
 
 
906 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  41.38 
 
 
893 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  41.11 
 
 
919 aa  635  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  41.9 
 
 
867 aa  635  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  41.83 
 
 
899 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  41.79 
 
 
897 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  40.57 
 
 
907 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  41.52 
 
 
912 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  39.79 
 
 
932 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  43.08 
 
 
836 aa  633  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  39.91 
 
 
932 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  39.91 
 
 
932 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  41.81 
 
 
844 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 
934 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  39.51 
 
 
936 aa  632  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  41.67 
 
 
914 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  39.95 
 
 
921 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  39.67 
 
 
936 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  42.07 
 
 
910 aa  632  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  41.67 
 
 
914 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>