251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0038 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 852 aa  1678    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl667  ribose ABC transporter permease component  32.86 
 
 		 612 aa  173  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 		 365 aa  157  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  35.05 
 
 		 365 aa  157  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf822  sugar ABC transporter permease protein  32.13 
 
 		 677 aa  154  5e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 365 aa  145  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 403 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0014  ribose/galactose ABC transporter  29.4 
 
 		 736 aa  134  7.999999999999999e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 365 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 357 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 383 aa  127  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 388 aa  126  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 360 aa  125  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 371 aa  124  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 442 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 358 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 356 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 354 aa  112  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 354 aa  112  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.07 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.83 
 
 		 355 aa  107  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.17 
 
 		 364 aa  106  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  29 
 
 		 348 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 362 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 344 aa  105  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 344 aa  105  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.6 
 
 		 373 aa  105  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 338 aa  105  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  24.52 
 
 		 400 aa  102  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 344 aa  102  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 357 aa  101  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 352 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 344 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.14 
 
 		 353 aa  98.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 454 aa  98.6  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.57 
 
 		 427 aa  97.4  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 352 aa  95.1  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 371 aa  94.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 352 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 451 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 475 aa  92.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  28.57 
 
 		 419 aa  91.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 410 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 367 aa  90.5  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 415 aa  90.1  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  26.53 
 
 		 359 aa  90.1  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 383 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 409 aa  89.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 462 aa  89  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 365 aa  88.6  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.52 
 
 		 471 aa  87.8  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 340 aa  87.4  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 463 aa  87.8  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 365 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  27.73 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  26.06 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 379 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  25.91 
 
 		 380 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 408 aa  83.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  28.81 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  28.81 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  25.43 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  26.9 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  24.14 
 
 		 366 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  26.33 
 
 		 347 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  24.71 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  23.53 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  26.23 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  26.43 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  26.73 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.4 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  26.64 
 
 		 349 aa  77  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  24.56 
 
 		 355 aa  77.4  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  27.2 
 
 		 349 aa  76.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  24.65 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.67 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  26.36 
 
 		 373 aa  73.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  23.55 
 
 		 352 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>