More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0017 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl672  cell division protein  67.84 
 
 
650 aa  856    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
650 aa  1320    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  56.84 
 
 
744 aa  556  1e-157  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  52.6 
 
 
715 aa  550  1e-155  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  48.08 
 
 
633 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  47.76 
 
 
633 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  47.92 
 
 
633 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  47.92 
 
 
633 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  47.92 
 
 
633 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  47.92 
 
 
633 aa  535  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  47.92 
 
 
633 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  47.92 
 
 
633 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.18 
 
 
632 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.51 
 
 
635 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 
697 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  47.28 
 
 
633 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 
697 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 
633 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.5 
 
 
700 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.43 
 
 
611 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  46.49 
 
 
708 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.41 
 
 
615 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  44.27 
 
 
695 aa  498  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  52.51 
 
 
658 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.4 
 
 
620 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 
632 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 
602 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.28 
 
 
693 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 
639 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  50.76 
 
 
628 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  50.79 
 
 
602 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  53.35 
 
 
655 aa  488  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.78 
 
 
628 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  53.54 
 
 
633 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  50.48 
 
 
613 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.78 
 
 
628 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
628 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.29 
 
 
601 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
601 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.31 
 
 
759 aa  482  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.75 
 
 
631 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
640 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
640 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  44.97 
 
 
640 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.61 
 
 
630 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  44.34 
 
 
617 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  49.53 
 
 
630 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.57 
 
 
638 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.08 
 
 
638 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.41 
 
 
628 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.73 
 
 
640 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  49.81 
 
 
617 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  49.81 
 
 
617 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.57 
 
 
647 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
616 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.86 
 
 
616 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.08 
 
 
682 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.58 
 
 
642 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.57 
 
 
638 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.9 
 
 
750 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.9 
 
 
642 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.41 
 
 
638 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.78 
 
 
608 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.64 
 
 
652 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.66 
 
 
647 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.76 
 
 
702 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.9 
 
 
642 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  43.79 
 
 
689 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
616 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  44.39 
 
 
644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.51 
 
 
637 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  52.29 
 
 
615 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.22 
 
 
638 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  44.39 
 
 
647 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  43.82 
 
 
628 aa  472  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 
643 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.33 
 
 
637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.3 
 
 
655 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.51 
 
 
783 aa  466  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 
630 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  50.1 
 
 
617 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  50.81 
 
 
616 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.28 
 
 
625 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  41.56 
 
 
681 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  44.11 
 
 
619 aa  469  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  44.23 
 
 
647 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  49.16 
 
 
613 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.49 
 
 
599 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  42.26 
 
 
638 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.83 
 
 
640 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.94 
 
 
640 aa  465  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  41.43 
 
 
646 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  49.9 
 
 
627 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.83 
 
 
640 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  41.54 
 
 
659 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  49.04 
 
 
637 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.9 
 
 
640 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.2 
 
 
812 aa  462  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.39 
 
 
616 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>