More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0008 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  100 
 
 
669 aa  1319    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  59.52 
 
 
631 aa  458  1e-127  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  48.65 
 
 
602 aa  268  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.25 
 
 
518 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.03 
 
 
447 aa  263  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.06 
 
 
565 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.06 
 
 
565 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.26 
 
 
550 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  50.64 
 
 
568 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.68 
 
 
562 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.68 
 
 
562 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  253  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.67 
 
 
478 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.34 
 
 
647 aa  252  1e-65  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.58 
 
 
527 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.89 
 
 
589 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.67 
 
 
478 aa  252  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  250  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.61 
 
 
517 aa  249  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.9 
 
 
421 aa  249  9e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.26 
 
 
562 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40 
 
 
559 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.72 
 
 
534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.02 
 
 
622 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.66 
 
 
518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  47.84 
 
 
548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
614 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.13 
 
 
561 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.18 
 
 
460 aa  243  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  36.62 
 
 
577 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.73 
 
 
599 aa  243  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.68 
 
 
496 aa  243  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0099  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.06 
 
 
603 aa  242  2e-62  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.51 
 
 
682 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.97 
 
 
611 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
560 aa  242  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.55 
 
 
547 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  38.8 
 
 
582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.65 
 
 
626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.04 
 
 
522 aa  241  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.76 
 
 
667 aa  239  9e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.76 
 
 
580 aa  239  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.23 
 
 
427 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.91 
 
 
588 aa  239  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.41 
 
 
550 aa  239  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.91 
 
 
602 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.3 
 
 
562 aa  238  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.75 
 
 
567 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.72 
 
 
547 aa  238  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.72 
 
 
547 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.56 
 
 
467 aa  238  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.9 
 
 
613 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 
499 aa  237  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.56 
 
 
455 aa  236  8e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.4 
 
 
589 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.3 
 
 
546 aa  234  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.43 
 
 
634 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
501 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  41.83 
 
 
575 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.71 
 
 
554 aa  234  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.64 
 
 
553 aa  234  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.3 
 
 
554 aa  233  6e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.91 
 
 
575 aa  233  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.61 
 
 
586 aa  233  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.73 
 
 
582 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.86 
 
 
554 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.68 
 
 
579 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  38.03 
 
 
625 aa  232  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.34 
 
 
582 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.73 
 
 
579 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39.72 
 
 
579 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.23 
 
 
529 aa  230  5e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  38.72 
 
 
614 aa  230  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.09 
 
 
688 aa  230  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
642 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
642 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
642 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
642 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.1 
 
 
644 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
642 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  43.59 
 
 
381 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.59 
 
 
643 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.91 
 
 
582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.23 
 
 
664 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.57 
 
 
664 aa  227  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>