More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0007 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0007  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  283  5.999999999999999e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl679  cytosine deaminase  43.57 
 
 
142 aa  106  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.622317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  26.85 
 
 
176 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.7 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26 
 
 
168 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.78 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  25.5 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  23.02 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.18 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  23.78 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  25 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.07 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.8 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  23.81 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.08 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.23 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.67 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.39 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.15 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  24.84 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  26.57 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  25.18 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  25.68 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.17 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  30.88 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.59 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  27.52 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  24.48 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.48 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  32.87 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  23.29 
 
 
175 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  22.22 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  29.73 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  25.52 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.52 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.5 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  25.66 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.52 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  32.37 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  23.74 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.77 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26030  tRNA-adenosine deaminase  23.02 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  30.37 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  27.91 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.37 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  28.57 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  25.9 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.6 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.6 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.37 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  26.62 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.23 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  25.36 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  25.69 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  25.17 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  27.59 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.19 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.26 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  22 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.47 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.52 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.17 
 
 
164 aa  66.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  24.66 
 
 
160 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.2 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.34 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  23.45 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.81 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  26 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  29.41 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  23.78 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  28.06 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.57 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.78 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.67 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.74 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.03 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.46 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1208  tRNA-adenosine deaminase  26.17 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.755847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.71 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.91 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.51 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.39 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  23.13 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  26.92 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.97 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.23 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  23.36 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.36 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.3 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  28.67 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  29.63 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.29 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.41 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  31.58 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  22.46 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  29.77 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>