More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3103 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  100 
 
 		 348 aa  723    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  31.51 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  31.79 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.23 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  31.02 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  33.13 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.64 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.31 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.65 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.42 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.22 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.67 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.58 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.8 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.11 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.59 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  28.77 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  28.77 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.12 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  28.77 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 244 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 		 490 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.13 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.46 
 
 		 392 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.64 
 
 		 402 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.07 
 
 		 445 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.17 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.75 
 
 		 506 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  27.76 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.64 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.64 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.9 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.97 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.79 
 
 		 420 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.83 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  36.91 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  34.18 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.86 
 
 		 447 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.3 
 
 		 429 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.16 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 637 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  31.94 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  27.9 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  36.49 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.34 
 
 		 264 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 445 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.18 
 
 		 218 aa  86.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  27.18 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  34.98 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  34.98 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  29.67 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.55 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  29.28 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  43.14 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  35.02 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  35.03 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.89 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.1 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  27.64 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.7 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  27.45 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.44 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  28.45 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1987 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.05 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.9 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  42.72 
 
 		 1793 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.67 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  27.3 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.12 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.57 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 		 1755 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  40.19 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>