More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3089 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
586 aa  1201    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
587 aa  690    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
589 aa  716    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
589 aa  714    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 
592 aa  706    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 
585 aa  723    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 
586 aa  798    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
592 aa  708    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 
588 aa  715    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 
611 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 
586 aa  707    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
584 aa  716    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
579 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
579 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
609 aa  629  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
587 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 
609 aa  622  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
609 aa  611  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
598 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 
587 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
556 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
554 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
554 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
561 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
554 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
559 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
570 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
563 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
559 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
551 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
557 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
561 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
551 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
560 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
561 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
575 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
556 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
556 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
556 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
556 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
556 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
556 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
556 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
556 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
550 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
551 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
556 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
550 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
556 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
559 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
551 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
564 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
561 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
568 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
562 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
562 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
562 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
553 aa  445  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
556 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
564 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
561 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
546 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
556 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
563 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
561 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
556 aa  435  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
557 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
553 aa  435  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
553 aa  435  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
556 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
553 aa  432  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
564 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
583 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
575 aa  423  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
551 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
546 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2238  arginyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
551 aa  419  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.361874  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
575 aa  419  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
549 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
569 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
575 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
586 aa  415  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
597 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
597 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0749  arginyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0173421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>