More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2999 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
224 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.24 
 
 
234 aa  174  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  48.1 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.5 
 
 
210 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  50.24 
 
 
211 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.29 
 
 
209 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.34 
 
 
216 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.83 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.5 
 
 
208 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 
497 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.83 
 
 
207 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.83 
 
 
205 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.83 
 
 
207 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.33 
 
 
207 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.83 
 
 
207 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.02 
 
 
209 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.78 
 
 
209 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.33 
 
 
205 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.5 
 
 
213 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.72 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.84 
 
 
207 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.27 
 
 
490 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.51 
 
 
211 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.75 
 
 
217 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.79 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  47.94 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.34 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.53 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.51 
 
 
209 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.53 
 
 
203 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.63 
 
 
214 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.91 
 
 
214 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.72 
 
 
217 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.72 
 
 
217 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.81 
 
 
204 aa  141  8e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  43 
 
 
492 aa  141  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
479 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.96 
 
 
221 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  43.54 
 
 
484 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.28 
 
 
207 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.15 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  43.43 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
352 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  42.38 
 
 
497 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.59 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  44.09 
 
 
484 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  41.9 
 
 
494 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.1 
 
 
236 aa  128  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
343 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.25 
 
 
352 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.58 
 
 
206 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
207 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
204 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.82 
 
 
344 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.32 
 
 
352 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
207 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.05 
 
 
213 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.61 
 
 
343 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.43 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.43 
 
 
214 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
228 aa  118  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.25 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
379 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.05 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.58 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.78 
 
 
343 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.72 
 
 
255 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.76 
 
 
223 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.31 
 
 
347 aa  114  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.63 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.04 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.32 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.82 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.96 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.89 
 
 
368 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.81 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.43 
 
 
218 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.9 
 
 
219 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.83 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.81 
 
 
536 aa  111  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.17 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.16 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.17 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.11 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.34 
 
 
356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.94 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.54 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.01 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
219 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.84 
 
 
360 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>