292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2967 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2967  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  565  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  51.88 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  41.2 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  43.31 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  38.44 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  36.36 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  36.9 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  34.74 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  35.44 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  29.02 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  29.17 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.69 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  30.85 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.79 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.73 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  31.71 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.07 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  27.7 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  26.58 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.69 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.69 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.69 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  24.31 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  29.92 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  28.38 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  27.69 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  29.33 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.9 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  25.37 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  24.41 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  22.91 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  24.15 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  28.82 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  28.64 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  27.55 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  29.58 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.84 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  24.63 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  23.27 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  30.38 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  27.55 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  22.94 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  25.6 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  30.09 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  27.52 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  26.26 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.22 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  24.73 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.12 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.98 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  29.59 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  29.08 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  26.88 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  26.88 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  27.52 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  26.33 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  20.74 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.4 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.7 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  20.74 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.41 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>