53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2866 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 170 aa  349  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  80.36 
 
 		 169 aa  288  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  79.29 
 
 		 170 aa  283  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  78.44 
 
 		 169 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  76.92 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  76.65 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  73.21 
 
 		 169 aa  261  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  75.76 
 
 		 175 aa  259  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 170 aa  255  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 170 aa  255  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  71.01 
 
 		 171 aa  254  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  71.6 
 
 		 171 aa  254  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 170 aa  254  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 170 aa  254  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  70.83 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  64.41 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  61.02 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  59.01 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  55.62 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  56.17 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  55.62 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  48.1 
 
 		 396 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50.61 
 
 		 392 aa  143  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.79 
 
 		 393 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50 
 
 		 392 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  45.86 
 
 		 393 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  47.13 
 
 		 393 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  43.67 
 
 		 403 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.04 
 
 		 393 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  31.06 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  55 
 
 		 119 aa  88.6  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  34.93 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  35.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  35.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  30.54 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  34.69 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  35.14 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  36.24 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  38.03 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  33.14 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  38.1 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  32.64 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  34.69 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  33.8 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  28.57 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  26.71 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  27.78 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.01 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  27.11 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  24.71 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>