More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2807 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  36.71 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  37.62 
 
 
832 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  30.86 
 
 
303 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  34.33 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.13 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.65 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  29.93 
 
 
311 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  38.46 
 
 
197 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.89 
 
 
200 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.46 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.39 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.65 
 
 
207 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
366 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  34.62 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  35.92 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
198 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.39 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
205 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
205 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
205 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  26.83 
 
 
193 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.29 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  28.86 
 
 
311 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
328 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
227 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  35.61 
 
 
226 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 
255 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
251 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  32.99 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.14 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  33.9 
 
 
219 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
195 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  27.19 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
248 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  29.33 
 
 
310 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.2 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.97 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  33.91 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.75 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  26.94 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  35.35 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.85 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  29.75 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.51 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  28.67 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  31.06 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.08 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.24 
 
 
200 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  29.37 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
363 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  29.91 
 
 
200 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.28 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  29.8 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>