125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2757 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  100 
 
 		 284 aa  534  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  35.37 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  29.91 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  33.83 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  32.5 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  26.22 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  32.5 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  36.55 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  27.35 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  30.74 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  31.17 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  36.89 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  28.41 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  26.47 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  30.56 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  27.44 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  35.44 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  29.88 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  29.02 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  25.29 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  32.51 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  26.27 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  30.71 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  25.35 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  25.35 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  25.73 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  25.73 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  26.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  29.03 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  23.36 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  28.33 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  24.76 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  29.6 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  27.09 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  29.2 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  24 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  34.43 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  28.4 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  26.24 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  30.63 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  30.53 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  29.2 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  31.69 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  26.19 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  28.98 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  40.58 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  26.87 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  26.27 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  26.27 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  30.32 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  29.8 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  23.94 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  25.4 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  27.7 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  26.27 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  27.05 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  25.81 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  41.18 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  25.81 
 
 		 322 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  24.63 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  25.81 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  25.81 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  25.12 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  26.27 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  27.2 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  27.73 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  35.14 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  27.5 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  23.55 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  25.94 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  23.47 
 
 		 344 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  24.26 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  29.37 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  23.76 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  27.23 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  27.86 
 
 		 356 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  29.17 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  25.81 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  23.72 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  26.32 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  29.13 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  30.53 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  26.32 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  23.14 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  25.18 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  24.15 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  25.81 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  28.39 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  26.22 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  23.97 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  27.97 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  33.7 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  28.78 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  27.97 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  24.07 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  30.41 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  25.18 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  23.14 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  27.97 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>