267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2729 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  100 
 
 
172 aa  353  4e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  55.7 
 
 
165 aa  188  3e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
163 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  50 
 
 
177 aa  173  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  48 
 
 
183 aa  171  4e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  50.92 
 
 
171 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  53.16 
 
 
162 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  168  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
166 aa  167  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  47.8 
 
 
162 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  50.97 
 
 
160 aa  164  6e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 
162 aa  163  1e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  50.3 
 
 
167 aa  161  4e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 
162 aa  161  4e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  1.00648e-11 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.30652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  41.88 
 
 
162 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  52.8 
 
 
161 aa  159  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 
162 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  48.39 
 
 
160 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 
160 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 
160 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 
167 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 
167 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
171 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.38 
 
 
161 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.86123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 
175 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 
161 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  48.7 
 
 
160 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 
161 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  52.52 
 
 
160 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
171 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  55.32 
 
 
163 aa  154  5e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
160 aa  154  5e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  54.81 
 
 
160 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 
172 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  50 
 
 
163 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  52.59 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.45 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 
169 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 
172 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  46.2 
 
 
167 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  50 
 
 
166 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  50 
 
 
196 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  50 
 
 
196 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 
166 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  50 
 
 
159 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  50 
 
 
159 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  50 
 
 
159 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  50 
 
 
159 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  50 
 
 
196 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
161 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  45.4 
 
 
167 aa  148  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 
159 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.34 
 
 
174 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
159 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
159 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
159 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
159 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
159 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  44.19 
 
 
173 aa  147  1e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  146  1e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
166 aa  146  1e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
170 aa  145  2e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.3 
 
 
167 aa  145  2e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 
170 aa  146  2e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  44.94 
 
 
159 aa  146  2e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 
160 aa  145  4e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
165 aa  145  4e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.67 
 
 
167 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
166 aa  144  7e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 
159 aa  144  7e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 
160 aa  144  8e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 
179 aa  144  8e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
164 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  45.62 
 
 
163 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 
159 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  45.64 
 
 
159 aa  141  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  5.05034e-05 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  45 
 
 
166 aa  140  1e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  49.29 
 
 
163 aa  140  1e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
167 aa  140  1e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 
166 aa  139  2e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
171 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  45 
 
 
163 aa  138  4e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.26 
 
 
195 aa  137  5e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
198 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  44.81 
 
 
161 aa  137  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
169 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  36.71 
 
 
161 aa  137  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
161 aa  137  8e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 
160 aa  137  8e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>