131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2648 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1524    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  65.84 
 
 		 765 aa  1025    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  68.82 
 
 		 759 aa  1051    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  68.16 
 
 		 760 aa  1073    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  41.05 
 
 		 738 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  45.96 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  45.94 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  40 
 
 		 470 aa  326  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  39.72 
 
 		 798 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  40.14 
 
 		 467 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  41.36 
 
 		 472 aa  313  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  38.19 
 
 		 717 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  41.07 
 
 		 485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  37.73 
 
 		 717 aa  303  8.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  37.73 
 
 		 717 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  53.16 
 
 		 716 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  39.45 
 
 		 450 aa  299  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  51.29 
 
 		 720 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  51.31 
 
 		 712 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  51.31 
 
 		 712 aa  297  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  51.31 
 
 		 712 aa  297  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  50.98 
 
 		 712 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  37.89 
 
 		 524 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  34.05 
 
 		 725 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  38.32 
 
 		 695 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  45.77 
 
 		 479 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  37.68 
 
 		 749 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  35.65 
 
 		 782 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  43.65 
 
 		 731 aa  256  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  35.65 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  35.65 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  34.68 
 
 		 874 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  34.68 
 
 		 874 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  43.88 
 
 		 682 aa  243  7e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.71 
 
 		 882 aa  227  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  35.08 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  35.08 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  33.82 
 
 		 900 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  34.66 
 
 		 843 aa  208  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  32.42 
 
 		 857 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  33.92 
 
 		 842 aa  201  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  34.6 
 
 		 697 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  32.92 
 
 		 613 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.28 
 
 		 955 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.42 
 
 		 723 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  34.52 
 
 		 612 aa  173  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  27.34 
 
 		 774 aa  170  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  28.86 
 
 		 770 aa  167  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  31.62 
 
 		 788 aa  163  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  29.27 
 
 		 624 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  28.82 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  32.92 
 
 		 799 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  28.32 
 
 		 632 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  34.55 
 
 		 930 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.22 
 
 		 828 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  24.68 
 
 		 531 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  39.41 
 
 		 739 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  26.25 
 
 		 769 aa  97.8  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.01 
 
 		 486 aa  94.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  40.21 
 
 		 841 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  26.91 
 
 		 606 aa  90.5  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  23.4 
 
 		 540 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  32.65 
 
 		 834 aa  84.7  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  41.57 
 
 		 272 aa  83.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  34.65 
 
 		 838 aa  83.2  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.05 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  30.77 
 
 		 847 aa  72.4  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  34.29 
 
 		 845 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  36.36 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  25.07 
 
 		 978 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  23.43 
 
 		 771 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.51 
 
 		 1285 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  25.16 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  25.11 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23.68 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.6 
 
 		 1172 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  22.95 
 
 		 1172 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  25.4 
 
 		 979 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  25.4 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  28.48 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  20.83 
 
 		 1000 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  27.14 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  25.07 
 
 		 1145 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  42.39 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  32.17 
 
 		 880 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  35.85 
 
 		 718 aa  57.4  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  28.14 
 
 		 777 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  23.89 
 
 		 1061 aa  55.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  23.52 
 
 		 776 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  28.72 
 
 		 610 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  38.71 
 
 		 344 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  30.5 
 
 		 354 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  28.14 
 
 		 777 aa  54.7  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  34.44 
 
 		 350 aa  53.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.27 
 
 		 775 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  28.14 
 
 		 777 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  37.6 
 
 		 351 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  24.71 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  27.71 
 
 		 777 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>