More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2488 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 
383 aa  782    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  75.33 
 
 
393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.14 
 
 
403 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.98 
 
 
399 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  69.23 
 
 
406 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.57 
 
 
397 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.67 
 
 
397 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  68.68 
 
 
396 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.67 
 
 
397 aa  529  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.35 
 
 
403 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.75 
 
 
392 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.88 
 
 
389 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.14 
 
 
403 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.19 
 
 
403 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.35 
 
 
403 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.84 
 
 
404 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.84 
 
 
404 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.97 
 
 
395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  68.24 
 
 
402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65 
 
 
393 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.26 
 
 
403 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.74 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.35 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.74 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.57 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.19 
 
 
407 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.47 
 
 
402 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.74 
 
 
402 aa  494  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.95 
 
 
394 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65 
 
 
396 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.09 
 
 
403 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.84 
 
 
394 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.95 
 
 
434 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.26 
 
 
396 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.4 
 
 
396 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.36 
 
 
391 aa  471  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.66 
 
 
396 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.66 
 
 
396 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.66 
 
 
396 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.62 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.72 
 
 
410 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60 
 
 
396 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.88 
 
 
423 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.88 
 
 
405 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.88 
 
 
405 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.57 
 
 
411 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.21 
 
 
410 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.88 
 
 
423 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.62 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.62 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.62 
 
 
423 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.62 
 
 
423 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.36 
 
 
401 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.55 
 
 
407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.21 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  59.38 
 
 
424 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.13 
 
 
422 aa  448  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.81 
 
 
406 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.25 
 
 
404 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.33 
 
 
411 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.66 
 
 
413 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.48 
 
 
404 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.48 
 
 
404 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.51 
 
 
452 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.77 
 
 
396 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1998  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.64 
 
 
409 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.469724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  57.95 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  51.32 
 
 
396 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.34 
 
 
406 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.86 
 
 
402 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  47.88 
 
 
392 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.57 
 
 
402 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  45.41 
 
 
390 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.13 
 
 
406 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.56 
 
 
397 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.97 
 
 
417 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.41 
 
 
413 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  46.58 
 
 
388 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.57 
 
 
402 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.54 
 
 
408 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.89 
 
 
398 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.35 
 
 
408 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.23 
 
 
394 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.09 
 
 
408 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.67 
 
 
410 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.89 
 
 
401 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.98 
 
 
395 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.42 
 
 
419 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.09 
 
 
403 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  47.62 
 
 
393 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  45.65 
 
 
391 aa  364  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.49 
 
 
400 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.89 
 
 
397 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.11 
 
 
404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  48.36 
 
 
397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.09 
 
 
397 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.58 
 
 
393 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  47.49 
 
 
414 aa  359  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  46.63 
 
 
402 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.8 
 
 
428 aa  358  8e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>